1.苗立枯病
　　發生於幼苗期，種子感染後會造成不發芽，罹病部位水浸狀、暗綠色、軟腐造成倒伏。幼苗受害未倒伏時，受害組織變褐色、乾縮、細窄、幼苗生育不良。

防治方法： 注意田間排水。

2.病毒病（俗名：瘋欉）
　　依病毒種類、栽培品種及環境因素不同，其病徵亦不盡相同，這些病毒或單獨感染或複合感染，造成植株不同程度的病徵。病徵出現在新葉上，罹病較輕的植株，或不顯現病徵，或出現輕微的斑駁，常使植株生長不良。嚴重者新葉縮小，呈現明顯壞疽斑或水浸斑，果實上則呈現凹凸不平、色澤不均、變小或發育不良之畸型果或裂果，或造成植株矮化及生長停止，甚至死亡。

防治方法： 選種健康種苗。
提早拔除病株，拔除之病株需帶離園區或燒燬。
防治媒介昆蟲如棉蚜及南黃薊馬。
避免機械傳播，人為摘心整枝時最易於無意間將病毒傳播開來。

3.白粉病
　　可感染葉、葉柄、嫩蔓等部位產生灰白粉狀斑點，病斑擴大，互相連結，佈滿全葉影響光合作用，終使葉片枯死。病斑上之灰白色粉末狀的分生孢子與菌絲，藉風傳播，於春、秋兩季較乾燥及光線不足的環境下危害劇烈。如病害繼續進行，被害葉即變黃而枯萎，發生嚴重時，全株表面皆覆滿白色粉狀物而呈青白色。

防治方法：
栽培抗病品種如台南9號、農友秋華2號。
保持良好通風狀況，避免葉及莖蔓過於茂密。
輪流施用藥劑，以避免抗藥性產生，並遵守安全採收期。

4.露菌病
　　本病害在20℃左右，濕度高時發生特別嚴重。病斑由近根部葉片開始出現，並向新葉蔓延，葉片受害時，初期產生黃色角斑，病斑受葉脈限制，後黃色斑點轉變為棕色，患部乾枯。病原菌之孢子柄由葉背氣孔突出，濕度高時，於病葉背面病斑處，可見灰色黴狀物是病原菌的菌絲與胞囊，嚴重時葉片迅速枯死，影響植株生長及果實發育。胞囊為主要感染源，病原菌亦可在被害莖、葉中形成卵孢子殘存於土中。

防治方法：
採用設施栽培，隔絕雨水、露水。
輪流施用藥劑，以避免抗藥性產生，並遵守安全採收期。

5.蔓枯病（俗稱：敗頭）
　　由表皮侵入幼苗子葉及莖蔓，被害部初呈淡黃綠色油浸狀，被害組織終呈流膠或乾枯，尤其接近地面之莖基部造成潰瘍腐爛病徵。病斑上散生許多黑色小粒狀之柄子器和子囊殼，在潮濕環境下患部會有橘紅色的流膠，末期整株死亡。葉片或葉柄受害，呈水浸狀黃化壞疽，提早枯死。病原菌除隨風吹送外，雨水飛濺為主要傳播途徑。
防治方法：
採用抗病品系如台南試交13、30號
保持通風良好，勿使葉蔓生長太茂密。
輪流施用藥劑，以避免抗藥性產生，並遵守安全採收期。

6.黑點根腐病
　　本病害地上部病徵出現在果實採收前2～3星期，葉片呈雨傘狀急速萎凋似青枯狀，或黃化枯死，地下根系變小，根部呈水浸狀褐變，細根腐爛脫落，於枯死的根上散生著許多黑色的子囊殼。本病害為造成洋香瓜結果期急速萎凋的病因之一。
防治方法：
加強栽培管理及合理整株留果，強壯瓜株根系，提高根莖比。

7.細菌性果斑病
　　果實上的典型病徵為果皮上的小型斑點，深褐色或橄欖色，有水浸狀暈環或無水浸狀暈環，果皮上的斑點大都不會擴大，但病原細菌已侵入果肉組織造成水浸狀、褐腐或木栓化病徵；有些品種則於果皮上出現不規則水浸狀斑塊，罹病初期病變只侷限在果皮，但中、後期病原細菌亦會向果肉蔓延。除危害果實外，子葉、本葉及莖蔓均可受害，本葉上病徵似露菌病受葉脈限制，但會沿葉脈蔓延，深褐色水浸狀，在高濕度環境下，病斑上可見病原細菌泌出的乳白色痕跡。感染幼葉而病勢未繼續蔓延時，會造成病斑破裂、葉變形的病徵，危害莖蔓形成水浸狀褐色病斑，漸擴大而枯萎。葉、莖罹病嚴重時除影響植株生長勢外，將是危害果實的主要感染源。

防治方法：
　　不論採種田在國內或國外，確實做到「病田不採種」。
種子以1％鹽酸浸漬20分鐘後，以清水流洗20分鐘、風乾後播種，可以降低發病率。
田間管理注重在田間衛生工作的徹底執行，避免將罹病瓜苗移植本田，隨時清除病葉、病果。
採用隧道式栽培，可以隔絕雨水，減輕雨水飛濺而散播病原細菌。

8.棉蚜（俗名：瓜蚜、龜神、苔）
　　棉蚜為瓜類病毒病之最重要媒介昆蟲。在植株上多群集於老葉或新梢、嫩芽或幼葉上吸食汁液，被害植株生長受阻，被害葉捲縮而瓜蔓無法伸展。所分泌之蜜露可誘發煤病，污染瓜果或植株並影響光合作用。本蟲一般於秋末開始發生，初春至春末為發生高峰期。
防治方法：
懸掛黃色粘紙或水盤誘殺成蟲。
施用藥劑防治，並遵守安全採收期。

9.南黃薊馬（俗名：苔）
幼苗時即可發現成蟲及若蟲危害，蟲體極小，若蟲淡黃而成蟲呈淡黃或橙黃色，翅透明，成、若蟲均以銼吸式口器自葉部或心梢吸食汁液，被害葉片表面可見到無數蒼白小斑點，沿著葉脈基部向葉尖逐漸延伸，如果細察葉背，則可見到如針尖之小蟲爬行。被害植株頂端生長停止，葉背初期呈白色反光狀，後期則萎縮褐化，開花期部份成、若蟲移至花器為害，影響授粉。本蟲在高溫之春季乾旱期為發生盛期。
防治方法：
懸掛藍色粘紙或水盤誘殺成蟲。
施用藥劑防治，並遵守安全採收期。

11.銀葉粉蝨（俗名：白龜神、白粉蝨、白蚊子）
銀葉粉蝨全年發生，繁殖力強，寄主植物廣。成蟲產卵豎立於葉背，孵化後之若蟲有4齡，1齡蟲有足可短距離爬行，尋找適當部位取食，2齡以後足退化固著於葉背。本蟲直接刺吸植株養液導致生長衰弱。此外成蟲及若蟲分泌蜜露可誘發煤病，污染葉片及瓜果，影響植株光合作用，並使瓜果失去商品價值。秋末至春天為其發生盛期，暖冬發生尤為嚴重。
防治方法：
懸掛綠色粘紙或水盤誘殺成蟲。
施用1藥劑防治，並遵守安全採收期。

12.瓜實蠅（俗名：瓜蠅、瓜蜂）
瓜實蠅為洋香瓜果實之主要害蟲，周年可見， 4～9月為發生之高峰期。洋香瓜幼果果皮變硬前，雌蟲以產卵器刺入幼果並產卵於果實組織內，孵化後幼蟲即鑽入果內蛀食，造成被果腐爛或畸形、彎曲而不能成長，老熟幼蟲，鑽出瓜果，潛入土中化蛹。

防治方法： 果實套袋。
害果之幼果以廢棄之塑膠袋密封曝晒或搬離瓜園。 懸掛克蠅溶液誘殺雄蠅。